Одно из решений наших партнеров при обновлении на сервере стало выбрасывать ошибки типа Исправляем ошибку Unable to obtain public key for StrongNameKeyPair в NHibernate. Проблема решилось выполнением 2 комманд

sn.exe -m n

sn.exe -c

и установкой прав "Modify and Write" на папку C:\Documents and Settings\All Users\Application Data\Microsoft\Crypto\RSA для учетной записи, под которым работает пул сайта в IIS.